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吉林农业大学设有15个学院，1个研究生学院，2个直属教学部门。拥有7个博士后科研流动站，5个一级博士学位授权学科，21个二级博士学位授权学科，17个一级硕士学位授权学科，78个二级硕士学位授权学科，59个本科专业，1个国家重点（培育）学科和13个省部级重点学科。学校现有国家级科研平台1个，34个省部级科研平台，4个国际合作与校企合作平台，各种类型校内外实践教学基地315个。
学校依托雄厚的学科实力和教学科研资源优势，坚持"以服务地方经济建设和社会发展为己任"的办学理念，倡导"明德崇智、厚朴笃行"的校训精神，以内涵发展为主题，大力推进以提高教学质量和学生综合素质为核心的教育教学改革，探索并运行了"基础+平台"的人才培养模式，努力培养宽口径、厚基础、强能力、高素质的复合型与创造性人才。坚持科技为地方经济建设服务的方针，走出了一条"把论文写在吉林大地上"的科教服务之路。
