但“985”大学总体生源质量也存在明显差异，在别敦荣的研究中，排名最前的清华大学得分为98.69分，排名最末的西北农林科技大学得分为13.07分。
以两校2011年在河南录取的理科平均分数为例，西北农林科技大学为603分，清华大学高达683分。
据武书连在其制作的《2012中国大学本科毕业生质量100强》表格中显示，“生源质量排名”前9位全部由“985”大学占据，依次是清华、北大、中国科大、上海交大、复旦、浙大、人大、南京大学。外交学院排在了第十位。
武书连告诉中国青年报记者，“生源质量排名”所依据的主要是新生录取分数线。
不过，“985”大学也受到了一些热门专业大学的竞争，如外交学院、国际关系学院等外交类专业院校，对外经贸大学、中央财经大学等经济类专业院校，北京外国语大学、上海外国语大学等外语类专业院校。这些院校的高考平均录取分数线，大多能排在全国的前20名之内，录取分数远远高于“985”大学中录取分数靠后的大学。
作为专业院校，南方科技大学是第一所跻身于生源质量排名前列的纯理工科大学。
在武书连的“生源质量排名”中，西北农林科技大学被排到了第120位。
在武书连看来，地理位置、校名、心理等因素会影响学生填报志愿。一些专业院校之所以有竞争性，比如涉及到“外”类的学校容易出现高分，是因为考生会因此憧憬今后的生活。“财”类的学校则会产生“钱”的联想，农林类大学难招生，因为考生马上就联想到贫困的农村。
部属高校生源地方化问题仍严重
别敦荣的研究还显示，“985”大学录取人数具有明显的属地化特征，优质生源青睐经济发达地区的“985”大学，处在经济发达省区的“985”大学更容易获得优质生源。
例如，北京、上海、江苏三地的经济发展水平在全国处于领先地位，这些地区的“985”大学也获得了相对较好的生源，生源质量排名靠后的大学主要分布在边远省份。全国各地绝大部分优质生源选择了清华大学、北京大学、上海交通大学等地处经济文化发达城市的大学，其他内地大学对它们几乎没有构成生源竞争威胁。
但在北京和上海之间，仍存在差距，比如，地处上海的复旦大学、上海交通大学，在本地招收的生源质量也比北京大学、清华大学弱。
别敦荣告诉中国青年报记者，造成“985”大学优质生源地域差异的原因，表面上看，是由于“985”大学招生录取人数和录取分数的差异，即源于我国高等教育分省招生计划制度。但从根本上说，是因为各省市经济、文化、人口、教育等发展不均衡的特殊国情。经济发达的城市和地区对“985”大学支持力度更大，具有更富吸引力的文化影响，能够提供更多的就业机会，考生更愿意报考分布在这些地方的“985工程”大学。
数据统计也显示，2007年，34所一期“985”大学共招生14.6万人，其中，各“985”大学属地化比例平均值高达36.18%。
记者统计也发现，浙江大学连续数年以60%以上的本地生源比例，高居部属院校本地生源比例排行榜首位。另外，南京大学、复旦大学、华南理工大学的生源本地化现象也非常严重。而教育部期待的数据是30%以下。
属地化比例平均值高达36.18%，而“985”大学在另外13个无“985”大学省份的招生比例平均仅为1.75%，两者之间出现的巨大差距，也说明了当前高考录取结构的严重失衡。
